Cette "allergie" (je pense qu'on peut plutôt parler de réaction) était peut-être dû à l'urine ou de ses selles. Si ton bébé a la peau sensible et que son urine ou ses selles sont très acides (à cause de son alimentation ou si il fait ses dents, gastro ou autres) les fesses vont être rouges voire parfois très rouges avec une impression de brûlure genre des cloques.
C'est arrivé à mon fils, du coup c'était éosine, fesses "à l'air" et quand pas possible, change fréquent pour éviter la macération.
Sinon voir quel type de tissu tu utilises: synthétique, naturel..., le type de lessive, la dureté de l'eau et effectivement les huiles essentielles. Mais pour moi si les couches avaient été lavé, re relavé, je pense qu'il n'y avait plus trave d'HE donc voir plutôt réponse du début.